В апреле 1959 года он был назван Физули в честь 400-летия со дня рождения поэта Мухаммеда Физули. Летом 1968 года археолог Мамедали Гусейнов обнаружил кости нижней челюсти человека перед неандертальцем-Азихантропом в Азыхской пещере в 15 км от райцентра.
Город, находящийся под оккупацией с 1993 года, был освобожден 17 октября 2020 года Вооруженными силами Азербайджана.